โรคโครห์นอาจส่งผลต่อส่วนใดส่วนหนึ่งของระบบทางเดินอาหาร5ผู้ป่วยร้อยละ 50 มีส่วนเกี่ยวข้องกับลำไส้เล็กส่วนปลายและลำไส้ใหญ่ ร้อยละ 30 มีส่วนเกี่ยวข้องกับลำ โรคโครห์น ไส้เล็กเท่านั้น และใน 20% ของกรณีจะแยกไปที่ลำไส้ใหญ่ นอกจากนี้ 25% ของผู้ป่วยต้องทนทุกข์ทรมานจากภาวะแทรกซ้อนของ perianal รวมถึงรอยแยกและรูทวาร บ่อยครั้งน้อยกว่ามาก (<10%) ผู้ป่วยอาจมีข้อร้องเรียน perianal เดี่ยว โรคทางเดินอาหารส่วนบน หรืออาการภายนอกลำไส้ (EIMs) ของโรค5สำหรับวัตถุประสงค์ในการวิจัยและการรักษา ซีดีถูกแบ่งออกเป็นชนิดย่อยฟีโนไทป์: อักเสบ เข้มงวด และกำปั้น ซีดีอักเสบมีลักษณะเฉพาะคือการอักเสบของระบบทางเดินอาหารโดยไม่มีหลักฐานของโรคที่บีบรัดหรือกำปั้น การอักเสบนี้อาจนำไปสู่การเกิดพังผืดและลำแสงตีบในที่สุด และผู้ป่วยเหล่านี้จะถูกจัดอยู่ในกลุ่มโรคหลอดเลือดตีบตัน เมื่อเกิดการเปลี่ยนแปลงของ fibrostenotic จะไม่มีกระบวนการใดที่จะย้อนกลับได้นอกเหนือจากการแทรกแซงการผ่าตัด