ด้วย PDO ที่คาดการณ์ได้น้อยกว่า การคาดการณ์ผลกระทบที่อาจเกิดขึ้นจาก El Niño อาจทำได้ยากขึ้น การวิจัยพบว่า PDO จะคาดการณ์ได้น้อยลงเมื่อโลกร้อนขึ้น เนื่องจากสภาวะที่ร้อนขึ้นส่งผลให้อายุขัยของ PDO สั้นลงอย่างมาก คุณลักษณะของมหาสมุทรที่เรียกว่าการแบ่งชั้นของมหาสมุทรตอนบนทำให้ชั้นมหาสมุทรตอนบนอุ่นขึ้นเร็วกว่าชั้นที่ลึกกว่า การแบ่งชั้นทวีความรุนแรงขึ้นภายใต้ภาวะโลกร้อน มหาสมุทรแปซิฟิก คลื่น Rossby ซึ่งเป็นคุณลักษณะของคลื่นใต้น้ำจะเคลื่อนที่เร็วขึ้นในผืนน้ำที่มีการแบ่งชั้นมากขึ้น ซึ่งทำให้อายุการใช้งานของ PDO สั้นลงอีก และลดเวลาที่ต้องใช้เพื่อเพิ่มกำลังและความเข้ม เมื่อใช้สถานการณ์การปล่อยก๊าซเรือนกระจกต่างๆ นักวิจัยพบว่าความสามารถในการคาดการณ์ของ PDO ลดลงอย่างรวดเร็วโดยขึ้นอยู่กับความรุนแรงของภาวะโลกร้อน